分子力场相关论文
分子动力学模拟可以用来研究生物大分子体系的各种性质,如:预测受体和配体之间的亲和力,模拟蛋白质的折叠过程,研究蛋白质与细胞膜......
对蛋白质折叠的研究是生命科学的前沿课题,近些年来利用计算机模拟蛋白质折叠已经成为一种重要的研究手段.但是许多人们感兴趣的生......
随着测序技术的不断提升,鉴定出的蛋白质突变不断增加,对蛋白质突变的致病性评估与致病机理探究,能够帮助人们发现潜在药物靶点,并......
混合焓在吸收、蒸馏、和萃取等化工分离过程设计中的一个重要参数。本文探讨用分子动力学方法计算二元溶液体系的混合焓的可行性,假......
锌蛋白约占整个PDB数据库中已知蛋白结构的10%。由于锌离子具有多种配位结构(4,5,6),并且其固有的柔性(配位数可变)特征[1],基于经......
分子力场作为许多分子动力学模拟和计算机辅助药物设计方法背后的计算模型,决定了这些理论方法的精度极限。这里,我们将介绍基于经典......
离子水合及生物分子体系内离子选择性的微观作用机制是人们长期探索的重要课题,其难点在于如何合理精确地描述上述体系内的离子-水......
基于COMPASS分子力场,利用分子动力学模拟方法和Materials Studio软件建立了低固化度交联耦合的双酚A型环氧树脂交联结构模型,并利......
PE-3500(及PE-3600)数据站是美国Perkin-Elmer公司红外分光光度计所带数据处理系统,我国已进口相当的数量。因此,大力开发它的应用......
分子力学,又称为分子力场计算或张力计算,它利用经验力场计算来确定分子几何构型和构象。该法已经成为研究立体化学的重要手段,特......
应用比较分子力场分析 (Co MFA)方法研究 4 -肟醚基喹唑啉类化合物抗烟草花叶病毒活性的三维构效关系 (3 D-QSAR) ,引入分子的摩尔......
分子力场的发展有关准确性、复杂性、可移植性这三方面的平衡。一些蛋白质体系的MD模拟对力场中构象能量参数的准确性要求很高......
我们完整的展示了一种基于拟合量子力学计算数据和实验热力学数据开发全原子力场的方法。对于一般的有机分子,其中的二面角多可......
研究表明真核生物蛋白质组中约有27%-41%的蛋白是天然无规的。许多疾病,如阿尔兹海默症、癌症、冠心病、糖尿病、淀粉样纤维病变......
<正>蛋白质天然态结构的稳定形成是其发挥生物学功能的生物物理基础,研究蛋白质残基间相互作用与其结构折叠形成的关系一直是结构......
生物大分子构象的研究一直是结构生物学乃至生物学上的一个非常重要的领域。随着科技的发展和研究方法的不断更新,现在已经有非常......
分子力场在科学研究中越来越重要,使用分子力场模拟的研究方法与传统实验相比,具有成本较低、并且可以准确的观察化学反应每个时刻......
RNA分析是现代分析科学中一个非常重要的课题,是诠释RNA功能、探究疾病分子机制的基础。传统实验方法测定RNA结构的成本高,且无法......
准确描述分子内和分子间相互作用是分子动力学模拟的基础。分子体系势能面描述的准确程度也决定了分子模拟计算结果的可靠性。国内......
对近两年来专利报道中三个系列24个磷脂酶A2抑制剂进行了三维构效关系的研究,采用分子场比较分析方法(CoMFA)寻找结构与活性之间的关系,建立了一......
本实验采用“活性类似物法”确定了烯丙胺类抗真菌化合物的药效构象,采用比较分子力场分析法(CoMFA)拟合了48个烯丙胺类抗真菌化合物对6种常见......
本实验采用“活性类似物法”搜寻到烯丙胺和苄胺类抗真菌化合物的药效构象。其与药物萘替芬、特比萘芬的晶体构象相同。以此构象构......
目的:验证网格点位置及数目变化会对CoMFA结果产生较大影响的想法。方法:采用三种不同步长对常规CoMFA生成的region作系统的平移研究。结果:网格点位置......
用比较分子力场(CoMFA)和比较分子相似性指数分析方法(CoMSIA)对一系列与DNA结合的氮蒽类化合物的潜在抗癌活性进行了3D定量构效关......
利用比较分子场分析 (Co MFA)方法 ,对 2 0种嘧啶 (氧 )苯甲酸类化合物进行了三维定量构效关系(3 D-QSAR)研究。得到了具有较强预......
艾滋病病毒在世界范围内的传播,严重地威胁到人们的身心健康.HIV-1蛋白酶的残基变异严重地削弱了药物的治疗效果.为了研究残基变异......
目的采用计算机辅助模拟设计对环糊精的包合作用进行理论研究,从分子水平对β-环糊精(β-CD)包合阿德福韦(PMEA)的可行性进行研究和探讨......
室温离子液体作为一种新型的反应介质正在受到人们的关注,近十年来成为了化学领域的研究热点。随着人们对离子液体结构与性质研究......
应用新一代可极化分子力场——原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场ABEEM/MM,结合精密量子化学方法,构建了精确的Mn2+-H2O相互作用......
分子力场是运用分子动力学方法准确预测物质热力学性能的前提。本文使用UFF(universal force field)力场模拟了混合制冷剂R410a......
利用分子力场和分子动力学(MD)的方法研究了Li-蒙脱石的结构构型,层间阳离子的水化行为、水分子的结构特征以及它们的扩散性质.分......
在制冷工程领域,精确可靠的热物性数据是制冷系统设计和优化、工质选取和应用的重要基础。随着计算机技术的不断进步和理论化学的迅......
蛋白质作为执行生物体内重要功能的载体,其传统的研究思想是“序列-结构-功能”范式。前人研究结果表明真核生物体内有大约有27%~41......
近年来,随着信息时代的发展和计算机运算能力的迅速提升,分子动力学模拟已在研究生物大分子的结构功能关系、探索疾病发生发展机制、......
热力学数据是化工过程和单元操作中的关键数据,在实验研究和化工设计中具有重要作用。随着计算机技术的进步和分子模拟理论的迅速发......
钻井平台技术的提升,使从更复杂环境下勘探开采和利用非常规油气资源得以实现,而在工程设计中,油气体系的粘度、密度等物理性质至关重......