福建永安市辣椒丛枝病植原体的分子检测及鉴定

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永安地区发病辣椒植株表现小叶、黄化、丛枝、簇芽等症状.利用植原体16S rDNA基因的通用引物R16mF2/R16 mR2和R16F2n/R16R2,对发病辣椒植株总DNA进行巢式PCR检测,获得约1.2 kb的特异性DNA片段.经测序并在GenBank数据库进行比对分析,共获得4条植原体特定的16S rDNA基因序列(CHY-C4-1、CHY-Y1-1、CHY-Y7-1、CHY-G1-1).将测得的4条序列与已报道的植原体序列进行同源性比对,并构建系统进化树,结果显示获得的4条植原体序列均聚类到16SrⅠ组,其中CHY-Y1-1、CHY-Y7-1、CHY-G1-1与16SrⅠ-B亚组植原体聚类到同一支,而CHY-C4-1与已报道的16SrⅠ组内的6个亚组均未聚类到一支,因此建议将CHY-C4-1命名为新的亚组.利用iPhyClassifier在线分析软件对获得的4条植原体序列进行虚拟RFLP分析,结果与进化树获得的结果一致.
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