我国有丰富的山羊品种资源,具有非常明显的特征,如高繁殖性、抗逆性、耐粗饲等特点。其中绒山羊以其优良的纤维生产特性在我们的日常生活中起着重要的作用。关于羊绒的研究始于二十世纪五十年代,随着羊绒加工业的发展,羊绒市场也出现了供不应求、价格上涨的趋势,国内外的羊绒消耗需求日益增长,因此我国优质的羊绒生产及研究也得到了有益发展。然而研究表明近年来羊绒的纤维细度变得越来越粗,羊绒的细度及质量受到绒山羊研究人员开始关注,并以如何提高羊绒的数量和质量作为研究方向,不仅如此,绒山羊的奶、肉及抗病抗逆性等资源都是研究重点。绒山羊基因-表型-变异相关数据是生物学家进一步筛选与经济性状相关主效基因的基础。本文在挖掘文献的基础上,首次提出将知识图谱技术应用到绒山羊基因-表型-变异实体关联关系领域。针对目前缺少绒山羊基因-表型-变异数据库的问题,采用自然语言处理的文献挖掘技术,从Pub Med生物医学文献库中自动提取绒山羊变异相关文献摘要,对原数据进行数据预处理,删除作者详细信息及出版商信息等数据,根据知识图谱实体关系结构保留文献PMID,标题及摘要等数据。通过知识抽取得到与绒山羊相关71个基因的表型变异关联数据,然后采用爬虫技术提取外部数据库基因相关信息,进一步补全和优化知识,提高知识图谱质量,基于知识图谱将关联关系进行可视化,采用Neo4j图数据库以三元组形式存储关系数据,同时设计开发了绒山羊基因-表型-变异知识图谱可视化平台,该平台提供实体查询、关系查询及完整的知识谱图展示。