【摘 要】
：
非洲猪瘟（African swine fever,ASF）是由非洲猪瘟病毒（African swine fever virus,ASFV）引起的一种烈性猪传染病,对全球的养猪业造成了巨大损失。由于ASFV复杂的遗传和进化机制,目前没有商品化疫苗和药物用于防控该病毒。本论文针对ASFV的进化机制和抗病毒药物等问题进行研究,取得了以下研究结果:1)发现ASFV基因组存在很大的多样性,这种多样性主要由核
论文部分内容阅读
非洲猪瘟（African swine fever,ASF）是由非洲猪瘟病毒（African swine fever virus,ASFV）引起的一种烈性猪传染病,对全球的养猪业造成了巨大损失。由于ASFV复杂的遗传和进化机制,目前没有商品化疫苗和药物用于防控该病毒。本论文针对ASFV的进化机制和抗病毒药物等问题进行研究,取得了以下研究结果:1)发现ASFV基因组存在很大的多样性,这种多样性主要由核酸序列的插入和缺失引起。分析基因组中发生插入和缺失的原因,发现它们主要是由ASFV基因组发生的大量同源重组引起。同源重组不仅导致基因组大小的变化,也导致基因编码的变化。进一步分析同源重组发生的原因,发现ASFV基因组中存在大量成簇分布的重复序列,它们可能促进了同源重组的发生。该项工作表明,同源重组是造成ASFV遗传多样性的主要原因,有助于加深对该病毒进化机制的理解。2)基于蛋白序列同源性和网络聚类方法,建立ASFV多基因组家族（Multigene family,MGF）蛋白的分类系统和相应的在线软件MGFC,并把MGF蛋白分为31类;对MGF蛋白类进行系统分析发现,相同家族的MGF蛋白类之间最相似,且具有共同的序列基序;MGF蛋白类内部遗传多样性较大,且主要由插入和缺失导致;MGF蛋白具有较大的结构和功能多样性,同一MGF家族的MGF蛋白类具有相似的二级结构、亚细胞定位和翻译后修饰等特征;结合分子进化和祖先状态重建分析,发现ASFV在进化过程中有不断丢失MGF蛋白的倾向。该项工作为MGF蛋白提供了一个详细的分类系统,并对其进行了序列、结构、功能和进化分析,为MGF蛋白的深入研究提供了基础。3)提出了一种靶向宿主蛋白的抗病毒药物研究思路:首先通过整合多个来源的数据,构建了ASFV与猪之间的蛋白-蛋白相互作用网络;对该网络分析发现与ASFV相互作用的猪蛋白在该网络中起着中心作用,其连接度和节点介数均显著大于其它猪蛋白,而最短路径长度显著低于其它猪蛋白;多个与ASFV相互作用的猪蛋白还与其它几种病毒相互作用,可作为广谱药物的潜在靶点;进一步预测了多个靶向猪蛋白与ASFV蛋白的潜在抗病毒药物,并通过分子动力学模拟研究了药物格尔达霉素与猪HSP90AB1蛋白之间的相互作用。该工作不仅可以加深ASFV与猪之间的蛋白-蛋白相互作用认识,而且有助于开发有效的抗ASFV药物。综上,本文通过生物信息学方法研究了ASFV的进化机制与抗病毒药物,发现了同源重组对于ASFV遗传多样性的贡献;系统阐述了ASFV编码的MGF蛋白特征和进化;最后预测了多个潜在的抗ASFV药物。该论文不仅有助于理解ASFV的进化机制及其与宿主的相互作用,而且有助于开发有效的ASFV疫苗和药物。
其他文献
水稻作为我国第一大粮食作物,土壤的盐渍化是近年来威胁水稻产量的重大因素。土壤盐渍化对植物带来的伤害最主要是由于高浓度的盐分带来的渗透胁迫、离子胁迫、以及伴随的氧化胁迫,如果能开发和创制耐受盐胁迫的水稻新品种,就可以利用盐碱化的土地。根据结构域分析,植物中的类受体蛋白激酶（Receptor-like kinases,RLKs）是具有胞外配体结合结构域、跨膜结构域和kinase激酶域组成是酶偶联受体,
电涡流阻尼是一种利用电磁感应现象产生的新型非接触式阻尼,相较于传统的粘滞阻尼和摩擦阻尼,电涡流阻尼具有无工作流体、维护少、寿命长、灵敏、可靠等优点,在振动控制领域具有广阔的应用前景,但土木工程结构振动具有速度低、质量大等特点,需提高电涡流阻尼的耗能效率。齿轮和齿条的组合可对电涡流阻尼的耗能效率进行有效放大,且为成熟的工业产品,性价比高、可靠性好,同时可根据实际需求输出惯性力,为结构振动控制提供新的
随着计算机技术的快速发展,计算机网络也随之大规模的飞速发展。在大规模网络中,网络的性能状况越来越被引起重视,如果对网络进行全网测量来获得网络性能状态,一方面会给网络带来额外的负担,影响本身的网络环境,另外一方面,对大规模网络进行全网测量消耗的时间会很长,使得很难快速掌握全网状况。基于稀疏表征的填充技术利用网络本身有的冗余性,使得仅仅需要通过测量部分数据,就能推断出全网数据。本文基于稀疏表征技术,从
结构可靠性定义为结构在规定时间内和规定条件下,完成规定任务的可能性。由此可见时间是影响结构可靠性的一个重要因素。实际工程中,结构因腐蚀、磨损或老化等因素,会出现性能随时间延长而衰减情况。此外,结构往往承受随时间变化的随机动载荷。这两个因素使得结构的响应随时间的变化而变化,结构的可靠度随时间的延长而降低。然而传统的静态可靠性分析忽略了时间这一重要因素,导致模型过于简化,所计算得到的静态可靠度过于乐观
随着社会经济的进步和计算机技术的发展,人工智能技术的推动和变革日新月异。在现今高性能计算与人工智能算法的推动下,多智能体系统（MAS）作为分布式人工智能的主要分支之一,已经广泛应用于机器学习、社交网络、金融网络、经济演化与博弈论等领域,包括但不限于计算机科学、生物学、医学、经济学和心理学。MAS已成为解决大规模复杂系统任务及相关模拟与分析的首选。智能体在MAS中所特有的自利性、社交性、反应性、预动
近年来,过渡金属硫族化合物（TMD）材料因其优异的光电特性在场效应晶体管（FET）、化学生物传感、逻辑电路等方面已得到了广泛的研究。在TMD FET中,如何提高其电学性能,实现器件的低功耗、高性能,目前仍是电子设备领域的研究热点之一。二硫化钼（MoS2）是TMD材料家族中研究最广泛的材料之一,具有载流子迁移率高,能量带隙可调等特性。然而,在MoS2 FET中易受费米能级钉扎效应的影响,表现出典型的
随着我国城市化进程加速和城市人口剧增,城区土地资源紧缺、交通拥堵等问题日益严重。因此,充分开发地下空间、拓展城市容积势在必行。但由于地质条件复杂,工程施工引起的塌方和沉降时有发生。因此,如何评估下伏空洞对地层及上部基础稳定性的影响变得日益重要。目前,空洞稳定性研究通常仅考虑竖向荷载作用并假设地层为理想均质体,与实际工程存在一定差异。为此,本文采用高性能有限元极限分析（Finite Element
随着中国综合实力的上升,中国迅速从一个在非洲仅有立足点的新兴大国转变为重要的利益攸关方。中国连续十年成为非洲第一大贸易伙伴,参与非洲重大基础设施建设,建立了各类文化中心,拥有近百万侨民。中共十八大以来,中国对非洲外交从“风险规避”到“主动塑造”,从“经济外交”转变为“全方位外交”,中国成为非洲安全事务的积极参与者。非洲之角处于中东和非洲安全冲突的交汇地带,受阿拉伯文化、伊斯兰文化和非洲文化的三重影
海上风机桩基础在风、浪、流等水平循环荷载作用下极易产生累积变形,影响风电机组的正常服役甚至导致风机整体失稳破坏。且我国东部近海海域广泛分布着深厚的软黏土层,桩周软黏土在长期循环荷载作用下极易产生超静孔隙水压力的累积及强度弱化,影响桩土的相互作用。本文采用理论、试验和数值三方面相结合的方式对软黏土地基海上风机桩基础在水平荷载下的累积变形规律进行深入研究。在此基础上针对土体特性提出了适用于黏土和砂土的
正极材料是影响二次离子电池寿命、充放电速度和续航能力等关键性能的短板,在充放电过程中其结构变化是导致电池容量和倍率性能退化的主要因素。本文结合实验研究结果,以镍基层状正极材料为研究对象,利用第一性原理计算方法。针对锂离子电池（LIB）和钠离子电池（NIB）镍基正极材料中过渡金属（TM）扩散、P2-O2相变和掺杂等问题,探讨结构稳定性对充放电过程中Li/Na离子扩散的影响。揭示正极材料在充放电过程中