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脂蛋白脂酶(Lipoprotein lipase, LPL)基因是一种在脂肪代谢过程中起关键作用的蛋白水解酶。LPL基因已被看做是影响IMF的候选基因。提高山羊脂肪沉积能力,有利于获得与山羊肌肉脂肪性状相关的标记位点。本研究选用安徽白山羊、波尔山羊、马头山羊、济宁青山羊、岷山黑裘皮羊、临朐奶山羊等6种山羊群体为试验动物,采用PCR-SSCP分析方法研究LPL基因的多态型,并运用GLM模型,对检测出来的的SNP及其与羊IMF的关联分析。1.根据GenBank上公开发表的相关山羊LPL基因,设计引物P1-P1o,应用PCR-SSCP分析方法在LPL基因上发现P1-SSCP多态位点,该位点上具有五种基因型AA、BB、AB、AC 和 BC。序列测定结果表明,P1-SSCP的变异是由碱基G→287A的替换造成的。在P6-SSCP多态位点上发现三种基因型AA、BB、 AB。序列测定结果表明,P6-SSCP变异是由碱基G→16997A的替换造成,Gln→Ser。 在P7-SSCP多态位点上发现三种基因型AA、 BB、 AB。序列测定结果表明,P7-SSCP变异是由碱基A→18313C替换造成,导致Asp→Ala。2.在上述6个群体中分析了PCR-SSCP位点的基因型分布情况,Hardy-Weinberg检验结果表明：在P1-SSCP位点上,除安徽白山羊之外,所有品种均达到Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。在P6-SSCP位点和在P7-SSCP位点上,所有品种均达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。3.根据SNP群体动力学分析,287G、18313A在6个群体中分布均较稳定,16997G在群体中表现一定特异性,安徽白山羊分布达0.9750,波尔山羊0.8828,马头山羊0.8333,临朐奶山羊0.7500,济宁青山羊0.7037,岷山黑裘皮山羊中分布率最低是0.6979。G-16997A与IMF呈负相关性；A-18313C位点与IMF显著相关联(P<0.05),这说明P7位点处A-18313C与脂肪沉积能力有相关性。