本文以Linux与Windows的竞争为主线，借助理论分析与案例分析相结合的研究方法，着重研究了知识产权保护与软件产业市场结构之间的关系，从而试图揭示软件产业市场结构及PC市场结构的决定因素和形成机理。 　　第一，本文介绍了Linux和Windows的发展历史，并对知识产权与软件产业市场结构的相关理论做了简要综述，在此基础上提出了本文研究的问题。 　　第二，本文考虑到由于厂商对知识产权保护程度的不同，形成了不同的商业模式，通过将网络外部性和产品纵向差异化引入传统的豪泰林模型，比较了Linux和Windows两种软件商业模式，进而研究了操作系统市场结构的决定因素和形成机理：在操作系统市场，软件厂商采取不同的商业模式竞争，不同的商业模式内生了软件厂商不同的竞争优势，从而在不同的操作系统市场呈现出双寡头竞争和单寡头垄断两种主要的市场结构。 　　第三，本文基于PC市场规模经济和网络外部性的特点，构建了扩展的豪泰林模型，研究了PC市场结构的决定因素和形成机理及厂商的不同商业模式。 　　第四，本文基于软件市场规模经济和网络外部性的特点，构建了扩展的单寡头垄断模型、伯川德模型和豪泰林模型将软件市场区分成四种典型的市场结构，进而研究软件市场结构和软件保护不同方式的作用机理。 　　第五，本文对全文的基本研究结论及可能的创新做了简要总结，并对中国软件产业的发展提出了若干政策建议。