正常体重、超重和肥胖儿童肠道菌群差异研究

来源 :东南大学 | 被引量 : 5次 | 上传用户:youyoudl
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本研究运用高通量测序技术对正常体重、超重和肥胖儿童肠道微生物的16Sr DNA进行测序,比较其微生物群落的物种多样性和群落组成差异;应用实时荧光定量PCR技术对三组儿童肠道内的直肠真杆菌、多形拟杆菌、双歧杆菌属和乳酸杆菌进行特异性扩增,比较它们在不同体重儿童肠道中的数量差异。结合以上两部分研究,形成对肥胖儿童肠道微生态结构的全面认识,分析肥胖儿童肠道菌群变化特点,探索肠道菌群与肥胖的关系,以期为通过调节肠道菌群防治肥胖提供理论依据。目的:1.比较正常体重、超重和肥胖儿童肠道菌群物种多样性和群落构成,分析不同体重儿童肠道菌群是否存在差异性。2.比较正常体重、超重和肥胖儿童肠道中直肠真杆菌、多形拟杆菌、双歧杆菌属和乳酸杆菌数量,分析不同体重儿童肠道中这些种属的数量差异。方法:1.采集30例正常体重、35例超重和35例肥胖儿童粪便并提取DNA,然后对16S rDNA V4区进行扩增,使用Illumina-HiSeq高通量测序平台进行测序,运用生物信息学技术对结果进行分析,比较三组菌群丰度和物种多样性,寻找组间有显著差异的物种。2.采集54例正常体重、53例超重和59例肥胖儿童粪便并提取DNA,根据待测菌的16S rDNA基因序列设计四种菌的特异性引物,进行实时荧光定量PCR反应,比较三组间四种菌的数量有无差异。结果:1.通过高通量测序,三组共获得了4320570条优质序列。Alpha多样性分析结果表明,三组的多样性指数中observed_species、Chao1指数和PD whole tree组间差异有统计学意义(P<0.05),而Shannon指数和Simpson指数在不同体重组间的差异没有统计学意义(P>0.05)。Beta多样性分析结果表明,正常体重和肥胖儿童肠道菌群组成差异显著(P<0.05),而超重与正常体重和肥胖儿童肠道菌群结构组成差异较小(P>0.05)。具体来看,单型拟杆菌(Bacteroides uniformis)、拟杆菌门S24-7科、霍尔德曼氏菌(Holdemania)、吉利蒙德(氏)颤螺菌(Guilliermondii)、克里斯滕森氏菌属(Christensenella)、消化链球菌科(Peptostreptococcaceae)、巨球型菌属(Megasphaera)、梭菌属(Clostridium)、哈氏梭菌(Clostridium hathewayi)、厌氧棍状菌属(Anaerotruncus)、柔膜菌门(Tenericutes)、柔膜菌纲(Mollicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、红椿杆菌纲(Coriobacteriia)、红椿杆菌目(Coriobacteriales)、红椿杆菌科(Coriobacteriaceae)、柯林斯菌属(Collinsella)、产气柯林斯菌(Aerofaciens)、青春双岐杆菌(Bifidobacterium.adolescentis)、草酸杆菌科(Oxalobacteraceae)、产甲酸草酸杆菌(Formigenes)、δ变形菌纲(Deltaproteobacteria)、脱硫弧菌目(Desulfovibrionales)、脱硫弧菌科(Desulfovibrionaceae)、脱硫弧菌属(Desulfovibrio)为正常体重组的主要菌群。普雷沃氏菌属[Prevotella]和克里斯滕森氏科(Christensenellaceae)在超重组显著增加。变形菌门(Proteobacteria)、β-变形菌纲(Betaproteobacteria)、伯克霍尔德氏菌目(Burkholderiales)、产碱杆菌科(Alcaligenaceae)、萨特氏菌属(Sutterella)、巴斯德氏菌目(Pasteurellales)、巴斯德氏菌科(Pasteurellaceae)、杆菌属(Aggregatibacter)、嗜血杆菌属(Haemophilus)、副流感嗜血杆菌(Parainfluenzae)、普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)、普雷沃氏菌属(Prevotella)、Prevotella.copri菌、Prevotella.stercorea菌、梭杆菌门(Fusobacteria)、梭杆菌纲(Fusobacteriia)、梭杆菌目(Fusobacteriales)、梭杆菌科(Fusobacteriaceae)、梭杆菌属(Fusobacterium)、纤毛菌科(Leptotrichiaceae)、纤毛菌属(Sneathia)、粪拟杆菌(Bacteroides coprophilus)、埃氏拟杆菌(Bacteroides.eggerthii)、韦荣球菌属(Veillonella)、殊异韦荣球菌(Veillonella.dispar)、巨单胞菌属(Megamonas)、活泼瘤胃球菌(Ruminococcus gnavus)、规则粪球菌(Coprococcus eutactus)、隐藏梭菌(Celatum)、产气荚膜梭菌(Perfringens)、瘤胃乳杆菌(Lactobacillus ruminis)在肥胖组显著增加。2.直肠真杆菌、多形拟杆菌、双歧杆菌属和乳酸杆菌在三组间的差异均有显著性(P<0.01)。直肠真杆菌在正常体重、超重和肥胖组的中位数分别是6.50(QR 5.83-7.02)、6.79(QR 6.28-7.38)和7.34(QR 6.91-7.78)。多形拟杆菌在正常体重、超重和肥胖组的中位数分别是5.00(QR 4.93-5.74)、4.77(4.69-5.44)和4.79(QR 4.69-5.36)。双歧杆菌属在正常体重、超重和肥胖组的中位数分别是8.31(QR 8.18-8.54)、8.31(QR 8.11-8.47)和7.33(QR 7.16-7.57)。乳酸杆菌在正常体重、超重和肥胖组的中位数分别是6.12(QR5.90-6.32)、5.85(QR 5.70-5.97)和5.29(QR 5.01-5.63)。结论:1.随着体质量的增加,物种的丰度显著降低。多样性指数在三组间未见明显差异。正常体重组和肥胖组菌群组成存在显著性差异,但超重组与正常体重组和肥胖组均存在一定的相似性,三组中一些特定菌群的比例发生了变化。2.直肠真杆菌的增加,多形拟杆菌、双歧杆菌属和乳酸杆菌的减少可能与超重和肥胖的发生发展有关。正常体重、超重和肥胖儿童肠道中直肠真杆菌、多形拟杆菌、双歧杆菌属和乳酸杆菌的数量受性别和年龄影响较小。
其他文献
默默6岁,在幼儿园总是调皮捣蛋,上课时不是到处跑,就是走神。家中的玩具也总扔得到处都是,急躁起来容易发火。妈妈觉得默默不对劲便带他到医院就诊。经医生仔细诊断,默默这是儿童
报纸
我国社会主义市场经济不断的发展中,对于法律制度方面也在不断完善,国家对各项制度实施深入性的改革,是为了进一步保证公民的基本权益,其中劳动法的完善,对于广大劳动者的切
志愿服务教育有利于进一步提升志愿者的综合素质,保证志愿服务活动的顺利有效开展,推动大学生的社会化进程。高校志愿服务教育的驱动模式包括:市场驱动模式、政府驱动模式和志愿
~~
期刊
一、养殖环境问题及对策1.问题。选择离村庄较近或在自家院落里建造鸡舍,场内布局不合理;没有排污设施或排污设施不完善,养殖场内污物随意堆放,污染严重;养殖户相互串门,不采取必要
目的 探讨血清标记物在预测持续性异位妊娠的临床价值。方法 回顾性分析在我院实施腹腔镜治疗的异位妊娠患者453例,发现患者发生持续异位妊娠(persistent ectopic pregnancy,P
目的 探究早期宫颈癌保留生育功能手术治疗后肿瘤复发和妊娠结局对临床诊疗的指导意义。方法 选取2005年~2015年山东省菏泽市立医院分院收治的早期宫颈癌患者120例,其中40例
1病历摘要患者男,50岁,农民。因乏力、食欲差、消瘦伴尿色深3个月于2008-03-25入住本院肾脏科。患者近3个月来出现乏力、食欲差、恶心、呕吐,呕吐胃内容物,非喷射性,当地医院行胃
铁合金虽应用广泛,但其强度仍不足。基于此,为强化铁基合金表面,获得综合力学性能,本文利用铁合金自身高碳含量,通过渗碳表面改性处理,以期达到强韧化表面目的。本文采用等温
随着国家法制建设的不断健全,差错事故医疗纠纷处理已进入法制轨道,人民群众自我保护意识及合理用药知识的不断提高,患者对医院的服务态度、医疗质量的要求越来越高,药房是医