产业内贸易一直是国际贸易研究领域的重要课题,现有理论及实证已经证明:产业内贸易的发展可以降低贸易自由化的调整成本,促进产业结构升级,实现比较优势的动态转化。就目前我国的研究状况而言,产业内贸易研究主要集中于工业制成品领域,而对农产品产业内贸易的研究却较少,具体到对中日农产品产业内贸易的研究就更是缺乏,这与中日农产品贸易对我国农产品贸易及中日双边贸易的重要性形成了鲜明反差。鉴于此,本文以中日农产品产业内贸易为研究对象,同时打破以往农产品产业内贸易研究中一般不包括林产品的局限,系统全面地探讨中日农产品产业内贸易的发展现状和影响因素,这有助于全面把握农产品贸易的发展趋势和存在的问题,对于农业产业结构升级及农产品贸易的健康发展具有重要的理论意义和现实意义。本文运用调整后的G-L指数及GHM方法,对中日农产品产业内贸易的发展水平及结构类型进行全面分析,得出:中日农产品贸易以产业间贸易为主,产业内贸易水平较低:产业内贸易以垂直产业内贸易为主,低质量垂直产业内贸易和低质量水平产业内贸易占据了大多数的细分产业。本文首次将Thom&McDowell方法应用到中日农产品贸易的研究中,利用边际产业内贸易指数从动态角度对中日农产品贸易进行分析,得出:中日农产品贸易增量主要是由产业内贸易引起的,其中垂直产业内贸易的贡献超过了水平产业内贸易。本文首次从国家特征及产业特征角度对中日农产品产业内贸易的影响因素进行了全面分析,研究得出:产品差异性不明显、规模不经济及区域经济一体化建设的滞后已对中日农产品产业内贸易产生了阻碍作用;并实证证明,国家规模、国际直接投资与中日农产品产业内贸易正相关,人均收入差距、要素禀赋差距及运输成本与中日农产品产业内贸易负相关。本文最后针对阻碍因素,提出了大力发展经济,通过加大科技投入和强化品牌建设提高产品差异性,通过农业产业一体化促进规模经济,通过加快中日自由区建设促进区域经济一体化等政策建议。