马一浮的思想有两个重心，一为六艺论，一为诗学思想，而后者又是前者的有机组成部分。 六艺论代表着马一浮完整而系统的学术观，这一思想主要由三个命题构成，即“六艺统摄一切学术”、“六艺统摄于一心”、“六艺互相统摄”马之标举六艺论，主张据六艺判教、以六艺统摄一切学术，其目的在借佛家判教之法，应对近代中国的学术分科大势，以坚守重博通重价值的中国学术传统。 复性书院是马一浮六艺论思想的教育实践。复性书院缘起于马对现代学校教育的强烈不满；其宗旨为综贯经术、讲明义理，确立六艺之教和复性之旨；其体制则独立于现行学制之外，采用佛教丛林制度，主张政治和经济独立，不为学生规定资格出路。围绕书院的宗旨和体制，马一浮和熊十力发生了激烈论争，熊主张建“国立文哲学院”，使传统儒学教育向现代学校教育作转化；马主张建“复性书院”，以传统儒学教育弥补现代学校教育之不足。而根据各自办学的经历，马一浮和梁漱溟却得出了完全一致的反思意见，二人都主张必须去除现代学校教育方式，否则儒学教育将成为知识之传授、口头之空谈，从而变得毫无意义。复性书院的创办，为传统儒学教育的现代转型提供了极富启发性的意见。 功夫论是马一浮六艺论思想中的修养方法论。马在朱子学的基础上，针对时代病痛，提出读书、穷理、涵养的道德修养功夫。这不仅是一种独创的理论思考，更是他一生道德实践的真实体现。它为儒学的重建指出一个新的向度。 “诗以感为体”，代表了马一浮的诗歌本体论。马认为，诗歌的本体，就是诗人自身的感动，其内容为情与志。感因史(主要是社会政事)而兴起，因玄(主要是心性义理)而校正，而感之深浅则取决于诗人胸襟之大小，感实同于佛教所说的觉。马的诗歌本体论，一方面把传统诗学中关于诗歌本体的讨论明确化和系统化，促进了传统诗学的创造性转化：一方面又融通诗歌创作和道德修习，融通诗学理论和道德哲学，为传统诗学的现代转型指出向上一路。 “诗教主仁”，代表了马一浮的诗教观。马的诗教观受“温柔敦厚”的传统诗教观之影响，顺承其“教化”说的观念而来，并有极大的突破，是对儒家诗教真精神的恢复和重建。