根据2009年3月2010年3月和2011年112月在洋山港近岸及港区进行的浮游动物监测结果，分析了洋山港近岸和港区浮游动物群落的季节变化、多样性、空间分布及其与环境因子的相关性。研究结果表明：1.洋山港近岸桡足类群落季节变化的研究结果显示：近岸共监测到桡足类32种，桡足类优势种有四刺窄腹剑水蚤（Limnoithona tetraspina）、太平洋纺锤水蚤（Acartia pacifica）、真刺唇角水蚤（Labidoceraeuchaeta）、针刺拟哲水蚤（Paracalanus aculeatus）、双毛纺锤水蚤（Acartia bifilosa）、小毛猛水蚤（Microsetella norvegica）、瘦拟哲水蚤（Paracalanus gracilis）和小拟哲水蚤（Paracalanus parvus）；桡足类丰度季节变化显著（F=2.11，p<0.05），春（14.01±3.53ind./L）>夏（11.93±9.73ind./L）>秋（7.44±2.36ind./L）>冬（5.47±1.15ind./L）。桡足类丰度的周年变化呈现双峰型特征。多变量分析显示，优势种的数量变化对洋山港桡足类群落丰度的季节变化起主要作用。小洋山码头为洋山港目前主要的货运码头，船流量较大，人类干扰严重，桡足类丰度和多样性与大洋山码头已出现差异，春、冬季小洋山码头的多样性指数（H’）高于大洋山码头，除秋季外，小洋山码头的均匀度指数（J）都高于大洋山码头。2.洋山港港区共监测到浮游动物52种，四季种类数无差异，表现为春季种类数最低，夏季种类数最高，其中春季26种，夏季29种，秋季27种，冬季27种。港区浮游动物年均丰度为11.50ind./L，季节波动明显，变化趋势为春季（22.6424.05ind./L，均值为25.04±1.74ind./L）>夏季（5.3414.94ind./L，均值为11.31±3.01ind./L）>秋季（0.409.27ind./L，均值为6.25±2.93ind./L）>冬季（0.744.95ind./L，均值为3.42±1.34ind./L），春季丰度与其余三季间存在极显著差异（p<0.01），夏、秋、冬季浮游动物丰度不存在差异（p>0.05）。洋山港港区东西走向的丰度空间分布特征为S1（11.16ind./L）>S2（9.46ind./L）>S3（8.12ind./L）>S4（7.03ind./L）>S5（6.94ind./L）。香农威纳指数的四季变化趋势为：夏季（1.59）>秋季（1.49）>春季（1.27）>冬季（1.07）；四季均匀度指数值分别为：春季，0.46；夏季，0.55；秋季，0.54；冬季，0.40。洋山港区域受到季风和水团的综合影响，有黄海冷水团、长江冲淡水、江浙沿岸流、台湾暖流等水系在洋山港交锋，导致洋山港水环境具有独特的变化特征，因此，造成了洋山港浮游动物多样性变化不规则。3.根据CLUSTER聚类和MDS排序结果，洋山港港区浮游动物群落的季节差异明显，除去9月外的夏、秋季月份与春季和冬季月份皆存在显著差异（p<0.05）。春季港区浮游动物群落可分为6组，群落相似性为65%；夏季浮游动物群落可分为6组，群落相似性为70%；秋季浮游动物群落可分为6组，群落相似性为60%；冬季浮游动物群落可分为3组，群落相似性为70%。港区各样点空间分布呈现出S1S3断面与S4、S5断面浮游动物群落丰度有显著差异（p<0.05），其中航道样点与大洋山和小洋山附近样点也有差异（p<0.05）。综合群落分析结果，建议洋山港设立港西、港中和港东三个断面，每个断面三个平行采样点，是目前最优化、最具代表性的洋山港监测设计方案。4.主成分分析（PCA）表明，各季节不同样点间环境因子皆存在显著差异。RELATE分析进一步得出，洋山港浮游动物丰度与环境因子存在显著相关关系，春季（ρ=0.49，p=0.001），夏季（ρ=0.51，p=0.001），秋季（ρ=0.43，p=0.001），冬季（ρ=0.26，p=0.001）。不同季节浮游动物群落所依赖的环境因子组合不同，这说明不同物种对于环境因子的适应性各异。春季，溶解氧和水温两个环境因子能够很好的匹配浮游动物群落丰度（相关系数0.658）；夏季，水温、盐度、pH和悬浮物是解释浮游动物群落的最佳环境因子组合（相关系数0.562）；秋季，水温是解释浮游动物群落的最佳环境因子组合（相关系数0.756）；冬季，水温和总氮是解释浮游动物群落的最佳环境因子组合（相关系数0.662）。各季节影响浮游动物群落的环境因子组合各不相同，但水温是各季节中共有的重要环境影响因子。